The invention concerns methods for applying evolutionary analyses to a set
of aligned homologous protein sequences for the purpose of predicting a
consensus model for the folded secondary structure of a protein family,
identifying distant homologs and denying distant homology, assigning
functional behavior to protein families, identifying protein pairs that
interact as they function, identifying episodes of sequence evolution
where functional behavior within a family is changing, and identifying
specific chemical units of the protein that change in concert with
changes in functional behavior. Accordingly, this invention is relevant
to the use of genomic information to understand homology, fold, behavior
and function in proteins.
L'invenzione interessa i metodi per l'applicazione delle analisi evolutive ad un insieme delle sequenze omologhe state allineate della proteina allo scopo di predire un modello di consenso per la struttura secondaria piegata di una famiglia della proteina, identificante gli omologhi distanti e negante l'omologia distante, assegnante il comportamento funzionale alle famiglie della proteina, identificanti gli accoppiamenti della proteina che interattivo mentre funzionano, identificando gli episodi di sviluppo di sequenza dove il comportamento funzionale presso una famiglia sta cambiando ed identificando le unità chimiche specifiche della proteina che cambiano di concerto con i cambiamenti nel comportamento funzionale. Di conseguenza, questa invenzione è relativa all'uso delle informazioni genomic capire l'omologia, il popolare, il comportamento e la funzione in proteine.
