A method for comparing DNA base sequences by comparing similarities between two amino acid sequences translated from two DNA base sequences, respectively, includes (1) a step of dividing each of the first DNA base sequence and the second DNA base sequence into groups of successive three nucleotides each, translating each of these groups of nucleotides into an amino acid, and thereby obtaining a first amino acid sequence and a second amino acid sequence, and (2) a step of determining similarities between each amino acid of the first translated amino acid sequence and each amino acid of the second translated amino acid sequence in view of nucleotide insertions or deletions in the first and second DNA base sequence and amino acid insertions or deletions in the first and second translated amino acid sequence. The method is repeated by shifting the base sequences one base at a time.

Eine Methode für das Vergleichen DNA der niedrigen Reihenfolgen, indem sie Ähnlichkeiten zwischen zwei Aminosäurereihenfolgen vergleicht, die beziehungsweise von zwei DNA niedrigen Reihenfolgen übersetzt werden schließt (1) einen Schritt des Teilens jede der ersten DNA niedrigen Reihenfolge und der zweiten DNA niedrigen Reihenfolge in die Gruppen der aufeinanderfolgenden drei Nukleotide jede ein, übersetzt jede dieser Gruppen Nukleotide in eine Aminosäure, und dadurch erhält eine erste Aminosäurereihenfolge und eine zweite Aminosäurereihenfolge und (2) einen Schritt der Bestimmung von von Ähnlichkeiten zwischen jeder Aminosäure der ersten übersetzten Aminosäurereihenfolge und jeder Aminosäure der zweiten übersetzten Aminosäurereihenfolge angesichts der Nukleotideinfügungen oder -auslassungen in der ersten und zweiten DNA niedrige Reihenfolge und Aminosäureeinfügungen oder -auslassungen in der ersten und in zweiter übersetzten Aminosäurereihenfolge. Die Methode wird wiederholt, indem man hintereinander die niedrigen Reihenfolgen eine Unterseite verschiebt.