Optimization of ligand affinity for RNA targets using mass spectrometry

   
   

The present invention provides methods for the identification ligand compounds that bind to target molecules such as proteins or structured RNA with as little as millimolar (mM) affinity using mass spectrometry. The methods may be used to determine the mode of binding interaction between two or more of these ligand compounds to the target as well as their relative affinities. Also provided are methods for designing compounds having greater affinity to a target molecule by identifying two or more ligands using mass spectrometry methods of the invention and linking the ligands together to form a novel compound.

La presente invenzione fornisce i metodi per i residui del ligand dell'identificazione che si legano per designare le molecole come bersaglio quali le proteine o il RNA strutturato con il poco quanto l'affinità millimolar (millimetro) usando la spettrometria totale. I metodi possono essere usati per determinare il modo di interazione obbligatoria fra due o più di questi residui del ligand all'obiettivo così come le loro affinità relative. Inoltre sono forniti i metodi per la progettazione dei residui che hanno affinità più grande ad una molecola dell'obiettivo identificando due o più ligands usando i metodi di spettrometria totale dell'invenzione e collegando i ligands insieme per formare un residuo del romanzo.

 
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~ 00122