This invention provides methods for determining the genotype of organisms
by hybridization analysis and, more specifically, to establishing the
relatedness of individual organisms within a species. The present
invention provides addressable arrays, comprising diversity panels of
nucleic acid molecules, in which the molecules on the array are
addressable or uniquely identifiable in some fashion. A diversity panel is
the result of a method that can distinguish sequence differences between
nucleic acid samples. As taught herein, a variety of methods may be used
to generate diversity panels. Subsequent to the generation of the
diversity panel, the nucleic acid products of the diversity panel are
separated for application onto an array. The separated diversity panel is
then delivered onto a substrate to create an addressable array and
hybridized with labeled nucleic acids. The genotype of an organism is
determined by the pattern of hybridization.
Αυτή η εφεύρεση παρέχει τις μεθόδους για το γενότυπο των οργανισμών από την ανάλυση υβριδοποίησης και, πιό συγκεκριμένα, στην καθιέρωση της συγγένειας των μεμονωμένων οργανισμών μέσα σε ένα είδος. Η παρούσα εφεύρεση παρέχει τις προσπελάσιμες σειρές, περιλαμβάνοντας τις επιτροπές ποικιλομορφίας των μορίων νουκλεϊνικού οξέος, στις οποίες τα μόρια στη σειρά είναι προσπελάσιμα ή μεμονωμένα ευπροσδιόριστα σε κάποια μόδα. Μια επιτροπή ποικιλομορφίας είναι το αποτέλεσμα μιας μεθόδου που μπορεί να διακρίνει τις διαφορές ακολουθίας μεταξύ των δειγμάτων νουκλεϊνικού οξέος. Όπως διδάσκεται εν τω παρόντι, ποικίλες μέθοδοι μπορούν να χρησιμοποιηθούν για να παραγάγουν τις επιτροπές ποικιλομορφίας. Μετά από στην παραγωγή της επιτροπής ποικιλομορφίας, τα προϊόντα νουκλεϊνικού οξέος της επιτροπής ποικιλομορφίας είναι χωρισμένα για την εφαρμογή επάνω σε μια σειρά. Η χωρισμένη επιτροπή ποικιλομορφίας παραδίδεται έπειτα επάνω σε ένα υπόστρωμα για να δημιουργήσει μια προσπελάσιμη σειρά και υβριδοποιείται με τα επονομαζόμενα νουκλεϊνικά οξέα. Ο γενότυπος ενός οργανισμού καθορίζεται από το σχέδιο της υβριδοποίησης.
