The invention provides a method of determining an amino acid sequence of a
parent polypeptide. The method consists of: (a) obtaining mass spectra of
two or more differentially labeled polypeptide fragments of a parent
polypeptide; (b) assigning a mass and a weighting characteristic to two or
more paired signals having a difference in mass corresponding to an
integer value of said differential label, the weighting characteristic
combining properties of each signal within said paired signals; (c)
selecting from the mass spectra a paired signal having the assigned mass
and a weighting characteristic distinguishable from non-peptide signals,
the assigned mass indicating the mass of a polypeptide fragment within the
spectra; (d) determining the difference in mass of the polypeptide
fragments; (e) assigning the mass differences a satisfying amino acid
name, and (f) orienting the assigned amino acid names. Also provided is a
method of determining the amino acid sequence of a polypeptide. The method
consists of: (a) constructing a graph from mass spectra of two or more
differentially labeled polypeptides, the graph comprising a node with mass
m, number of labels n, intensity i, and mass differential of labels
.delta.; (b) creating a node corresponding to a paired signal having
masses of about m and about m+n.delta., and (c) adding a labeled weighted
directed edge to the graph between any two nodes corresponding to a mass
of an amino acid, the labeled weighted directed edge combining properties
of the paired signals.
Η εφεύρεση παρέχει μια μέθοδο μια ακολουθία αμινοξέος polypeptide γονέων. Η μέθοδος αποτελείται από: (α) λήψη των μαζικών φασμάτων δύο ή περισσότερων διαφορικά επονομαζόμενων polypeptide τεμαχίων polypeptide γονέων (β) ορίζοντας μια μάζα και ένα χαρακτηριστικό στάθμισης σε δύο ή περισσότερα ταξινομημένα κατά ζεύγος σήματα που έχουν μια διαφορά στη μάζα που αντιστοιχεί σε μια αξία ακέραιων αριθμών της εν λόγω διαφορικής ετικέτας, το χαρακτηριστικό στάθμισης που συνδυάζει τις ιδιότητες κάθε σήματος μέσα στα εν λόγω ταξινομημένα κατά ζεύγος σήματα (γ) επιλέγοντας από τα μαζικά φάσματα ένα ταξινομημένο κατά ζεύγος σήμα που έχει την ορισμένη μάζα και χαρακτηριστικό έναν διακριτό στάθμισης από τα non-peptide σήματα, η ορισμένη μάζα που δείχνει τη μάζα ενός polypeptide τεμαχίου μέσα στα φάσματα (δ) καθορισμός της διαφοράς στη μάζα των polypeptide τεμαχίων (ε) ορίζοντας στις μαζικές διαφορές ένα ικανοποιητικό όνομα αμινο οξέος, και (F) προσανατολίζοντας τα ορισμένα ονόματα αμινο οξέος. Επίσης υπό τον όρο ότι είναι μια μέθοδος την ακολουθία αμινοξέος polypeptide. Η μέθοδος αποτελείται από: (α) κατασκευή μιας γραφικής παράστασης από τα μαζικά φάσματα δύο ή περισσότερα διαφορικά επονομαζόμενα polypeptides, η γραφική παράσταση περιλαμβάνοντας έναν κόμβο με τη μάζα μ, τον αριθμό ετικετών ν, την ένταση ι, και το μαζικό διαφορικό των ετικετών δελτα. (β) δημιουργώντας έναν κόμβο που αντιστοιχεί σε ένα ταξινομημένο κατά ζεύγος σήμα που έχει τις μάζες περίπου του μ και για m+n.delta., και (γ) προσθέτοντας μια επονομαζόμενη σταθμισμένη κατευθυνόμενη άκρη στη γραφική παράσταση μεταξύ οποιων δήποτε δύο κόμβων που αντιστοιχούν σε μια μάζα ενός αμινοξέος, η επονομαζόμενη σταθμισμένη κατευθυνόμενη άκρη που συνδυάζει τις ιδιότητες των ταξινομημένων κατά ζεύγος σημάτων.
