System, method and computer product for predicting protein- protein interactions

   
   

System, method and computer product for predicting protein-protein interactions. In this disclosure, there is at least one biological data source containing biological data. A protein-protein interactions prediction module accesses the at least one biological data source and predicts interactions with a target protein having known domain and motif information. The prediction module includes a search module that searches the at least one biological data source for a set of proteins with domain and motif information similar to the domain and motif information of the target protein. An extraction module extracts interaction proteins from the set of proteins. A cellular location module determines whether the extracted interaction proteins are co-located at the same cellular location as the target protein. An analysis module determines protein-protein interactions of the interaction proteins with the target protein based on interaction domains and motifs and cellular location.

Система, метод и компьютерная продукция для предсказывая взаимодействий протеин-proteina. В этом разоблачении, по крайней мере один биологический источник данных содержа биологические данные. Модуль прогноза взаимодействий протеин-proteina достигает по крайней мере одного биологического источника данных и предсказывает взаимодействия при протеин цели зная домен и данные по motif. Модуль прогноза вклюает модуль поиска ищет по крайней мере один биологический источник данных для комплекта протеинов с доменом и данными по motif подобными к домену и данным по motif протеина цели. Модуль извлечения извлекает протеины взаимодействия от комплекта протеинов. Клетчатый модуль положения обусловливает чо-razme5eny ли извлеченные протеины взаимодействия на таком же клетчатом положении как протеин цели. Модуль анализа обусловливает взаимодействия протеин-proteina протеинов взаимодействия при протеин цели основанный на доменах взаимодействия и motifs и клетчатом положении.

 
Web www.patentalert.com

< Regulatable, catalytically active nucleic acids

< Systems and methods for predicting specific genetic loci that affect phenotypic traits

> Methods for simulation of biological and/or chemical reaction pathway, biomolecules and nano-molecular systems

> Methods and kits for monitoring resistance to therapeutic agents

~ 00144