Cell-wall degrading enzyme variants

   
   

The present invention relates to variants of a cell-wall degrading enzyme having a beta-helix structure, which variant has at least one substituent in a position determined by identifying all residues potentially belonging to a stack; characterizing the stack as interior or exterior; characterizing the stack as polar, hydrophobic or aromatic/heteroaromatic based on the dominating characteristics of the parent or wild-type enzyme stack residues and/or its orientation relative to the beta-helix (interior or exterior); optimizing all stack positions of a stack either to hydrophobic aliphatic amino acids, hydrophobic aromatic or polar amino acids by allowing mutations within one or all positions to amino acids belonging to one of these groups; measuring thermostability of the variants by DSC or an application-related assay such as a Pad-Steam application test; and selecting the stabilized variants. Variant of a wild-type parent pectate lyase (EC 4.2.2.2) having the conserved amino acid residues D111, D141 or E141, D145, K165, R194 and R199 when aligned with the pectate lyase comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 are preferred.

Η παρούσα εφεύρεση αφορά τις παραλλαγές ενός ενζύμου υποβάθμισης κυψελοειδούς τοίχου που έχει μια δομή βήτα-ελίκων, ποια παραλλαγή έχει τουλάχιστον ένα substituent σε μια θέση που καθορίζεται με τον προσδιορισμό όλων των υπολειμμάτων που ανήκουν ενδεχομένως σε έναν σωρό χαρακτηρίζοντας το σωρό όπως εσωτερικό ή εξωτερικό χαρακτηρίζοντας το σωρό όπως πολικό, υδροφοβικός ή αρωματικός/heteroaromatic βασισμένο στα εξουσιάζοντας χαρακτηριστικά του ενζύμου γονέων ή άγριος-τύπων συσσωρεύστε τα υπολείμματα ή/και τον προσανατολισμό του σχετικά με το βήτα-έλικα (εσωτερικός ή εξωτερικός) βελτιστοποιώντας όλες τις θέσεις σωρών ενός σωρού είτε στα υδροφοβικά αλειφατικά αμινοξέα, τα υδροφοβικά αρωματικά είτε πολικά αμινοξέα με την άδεια των μεταλλαγών μέσα σε μια είτε όλες θέσεις στα αμινοξέα που ανήκουν σε μια από αυτές τις ομάδες μέτρηση thermostability των παραλλαγών από DSC ή μιας εφαρμογή-σχετικής με την δοκιμής όπως μια δοκιμή εφαρμογής μαξιλάρι-ατμού και επιλέγοντας τις σταθεροποιημένες παραλλαγές. Παραλλαγή pectate γονέων άγριος-τύπων lyase (ΕΚ 4.2.2.2) που έχει τα συντηρημένα υπολείμματα αμινοξέος D111, D141 ή E141, D145, K165, R194 και R199 όταν ευθυγραμμίζεται με pectate lyase περιλαμβάνοντας την ακολουθία αμινοξέος της ΑΚΌΛΟΥΘΗΣ ταυτότητας αριθ.: 2 προτιμώνται.

 
Web www.patentalert.com

< Process for the preparation of L-amino acids by fermentation and nucleotide sequences coding for the accDA gene

< Therapeutic anti-melanoma compounds

> Transcriptional intermediary factor-2

> Cadherin derived growth factor and its use

~ 00141