Taxonomic identification of pathogenic microorganisms and their toxic proteins

   
   

The present invention describes a method for the binding of pathogenic microorganisms and their toxic proteins with ligands that have been covalently tethered at some distance from the surface of a substrate: distances of at least fifteen .ANG. are required for microorganism binding ligand tethers and at least six .ANG. are required for protein binding ligand tethers. The ligands described herein include heme compounds, siderophores, polysaccharides, and peptides specific for toxic proteins, outer membrane proteins and conjugated lipids. Non-binding components of the solution to be analyzed are separated from the bound fraction and binding is confirmed by detection of the analyte via microscopy, fluorescence, epifluorescence, luminescence, phosphorescence, radioactivity, or optical absorbance. By patterning numerous ligands in an array on a substrate surface it is possible to taxonomically identify the microorganism by analysis of the binding pattern of the sample to the array.

La présente invention décrit une méthode pour l'attache des micro-organismes pathogènes et de leurs protéines toxiques avec les ligands qui ont été en covalence attachés à une certaine distance de la surface d'un substrat : des distances au moins de l'ANG. quinze sont exigées pour le micro-organisme le ligand qu'obligatoire attache et au moins l'ANG. six sont exigés pour la protéine le ligand obligatoire attache. Les ligands décrits ci-dessus incluent des composés, des siderophores, des polysaccharides, et des peptides de heme spécifiques pour les protéines toxiques, les protéines externes de membrane et les lipides conjugués. Des composants non contraignants de la solution à analyser sont séparés de la fraction attachée et l'attache est confirmée par la détection de l'analyte par l'intermédiaire de la microscopie, de la fluorescence, de l'epifluorescence, de la luminescence, de la phosphorescence, de la radioactivité, ou de l'absorbance optique. En modelant de nombreux ligands dans une rangée sur une surface de substrat il est possible d'identifier taxonomiquement le micro-organisme par l'analyse du modèle obligatoire de l'échantillon à la rangée.

 
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