Rapid method for determining potential binding sites of a protein

   
   

A method for discovering proteins and protein geometries, and a method for conducting whole proteome assays on a single test surface are disclosed. A test surface is provided featuring a surface containing a random distribution of randomly shaped features of a size from 10.sup.-10 meters to 10.sup.-8 meters in width, height, depth, and spacing. A sample containing proteins is provided to interact with the test surface long enough for protein molecules to locate and adsorb to complementary sites on the test surface. Unadsorbed proteins are washed away. Protein adsorption sites are then discovered using a means such as an atomic force microscope (AFM) to identify locations where proteins are adsorbed to the surface. The topology of the protein adsorption sites is precisely measured using an AFM. Protein surface topology is deduced by determining the complementary surface to the protein adsorption sites. A device that is diagnostic for a disease is prepared by determining the disease-specific adsorption site pattern on a given test surface, in contrast to the non-disease pattern.

Показаны метод для открывать протеины и geometries протеина, и метод для дирижировать все assays proteome на одиночной поверхности испытания. Поверхность испытания снабжена отличая поверхностью содержа случайно распределение случайно, котор формируют характеристик размера от метров 10.sup.-10 метры 10.sup.-8 в ширине, высоте, глубине, и размечать. Обеспечены, что взаимодействует образец содержа протеины с поверхностью испытания long enough для молекул протеина для того чтобы размещать и адсорбировать к комплементарным местам на поверхности испытания. Протеины Unadsorbed помыты прочь. Места адсорбцией протеина после этого открынным использованием середины such as атомный микроскоп усилия (afm) определить положения где протеины адсорбированы к поверхности. Топология мест адсорбцией протеина точно измерена использующ afm. Топология протеина поверхностная дедуцирована путем обусловливать комплементарную поверхность к местам адсорбцией протеина. Приспособление диагностическо для заболевания подготовлено путем обусловливать заболевани-speqificeski картину места адсорбцией на, котор дали поверхности испытания, in contrast to картина нон-zabolevaniem.

 
Web www.patentalert.com

< Protective helicobacter antigens

< Analysis apparatus and analysis method

> Dental materials with nano-sized silica particles

> Antisense modulation of fibroblast growth factor receptor 2 expression

~ 00120