Microchip arrays of regulatory genes

   
   

Microarray technology is a fast-growing field of biomedical research, aiming to investigate changes in molecular features of hundreds of genes. The multiple parallel processing of information generated from matrices of huge numbers of loci on a solid substrate has allowed the gathering of gene signatures defining specific biological states. A new approach has been developed to facilitate this process wherein genes of the same regulatory modality are selected. The transcriptional regulation of these genes is related to the same control element, the E-box, defined by the sequence CACGTG. PCR products of selected regions of all known genes either binding to this sequence or whose expression is dependent on this binding, as well as genes interacting with E-box-binding genes and control genes, are arrayed on a nylon membrane or other appropriate microchip susbstrate, which is then used as an E-box-specific microarray. The transcriptionally regulated profile of E-box-related genes specific to a given cultured cell sample is then determined by unique labeled cDNAs probes produced from RNAs isolated from the culture of interest.

La technologie de Microarray est un champ à croissance rapide de recherche biomédicale, visant à étudier des changements des dispositifs moléculaires des centaines de gènes. Le traitement parallèle multiple d'information produit des matrices des nombres énormes des lieux sur un substrat plein a permis le rassemblement des signatures de gène définissant les états biologiques spécifiques. Une nouvelle approche a été développée pour faciliter ce processus où des gènes de la même modalité de normalisation sont choisis. Le règlement de transcriptional de ces gènes est lié au même élément de commande, l'E-boîte, définie par l'ordre CACGTG. Les produits de PCR des régions choisies de toute l'attache connue de gènes ou à cet ordre ou dont l'expression dépend de cette attache, comme des gènes agissant l'un sur l'autre avec les gènes E-boîte-liants et les gènes de commande, sont rangés sur une membrane en nylon ou tout autre susbstrate approprié de puce, qui est alors employé en tant que microarray E-boîte-spécifique. Le profil transcriptionally réglé des gènes E-boîte-connexes spécifiques à un échantillon cultivé donné de cellules est alors déterminé par les sondes marquées uniques de DNAS produites à partir de RNAs d'isolement à partir de la culture d'intérêt.

 
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> Methods of using labeled probe molecules to quantify target molecules

> Porous inorganic substrate for high-density arrays

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