Microarray technology is a fast-growing field of biomedical research,
aiming to investigate changes in molecular features of hundreds of genes.
The multiple parallel processing of information generated from matrices of
huge numbers of loci on a solid substrate has allowed the gathering of
gene signatures defining specific biological states. A new approach has
been developed to facilitate this process wherein genes of the same
regulatory modality are selected. The transcriptional regulation of these
genes is related to the same control element, the E-box, defined by the
sequence CACGTG. PCR products of selected regions of all known genes
either binding to this sequence or whose expression is dependent on this
binding, as well as genes interacting with E-box-binding genes and control
genes, are arrayed on a nylon membrane or other appropriate microchip
susbstrate, which is then used as an E-box-specific microarray. The
transcriptionally regulated profile of E-box-related genes specific to a
given cultured cell sample is then determined by unique labeled cDNAs
probes produced from RNAs isolated from the culture of interest.
La technologie de Microarray est un champ à croissance rapide de recherche biomédicale, visant à étudier des changements des dispositifs moléculaires des centaines de gènes. Le traitement parallèle multiple d'information produit des matrices des nombres énormes des lieux sur un substrat plein a permis le rassemblement des signatures de gène définissant les états biologiques spécifiques. Une nouvelle approche a été développée pour faciliter ce processus où des gènes de la même modalité de normalisation sont choisis. Le règlement de transcriptional de ces gènes est lié au même élément de commande, l'E-boîte, définie par l'ordre CACGTG. Les produits de PCR des régions choisies de toute l'attache connue de gènes ou à cet ordre ou dont l'expression dépend de cette attache, comme des gènes agissant l'un sur l'autre avec les gènes E-boîte-liants et les gènes de commande, sont rangés sur une membrane en nylon ou tout autre susbstrate approprié de puce, qui est alors employé en tant que microarray E-boîte-spécifique. Le profil transcriptionally réglé des gènes E-boîte-connexes spécifiques à un échantillon cultivé donné de cellules est alors déterminé par les sondes marquées uniques de DNAS produites à partir de RNAs d'isolement à partir de la culture d'intérêt.