The invention concerns mass spectrometric analysis of known mutation sites
in the genome, such as single nucleotide polymorphisms (SNPs). The
invention uses minor amounts of primers with photocleavable linkers,
intermixed with a major amounts of primers without linkers, to produce
short mutation-containing DNA sequences by enzymatic amplification
procedures such as polymerase chain reactions (PCR). After this single
amplification procedure, the linker-containing PCR by-products are
extracted, washed and photolytically cleaved. Short oligonucleotides are
produced which facilitate mass spectrometric analysis. Additionally to the
use of linkers, some types of primers may contain blockers which stop the
polymerase copying process to achieve even shorter oligonucleotides for
analysis.
Η εφεύρεση αφορά τη μαζική spectrometric ανάλυση των γνωστών περιοχών μεταλλαγής στο γονιδίωμα, όπως οι ενιαίοι πολυμορφισμοί νουκλεοτίδας (SNPs). Η εφεύρεση χρησιμοποιεί τα δευτερεύοντα ποσά εγχυτήρων με τους photocleavable συνδετικούς εκδότες, που ανακατεύονται με σημαντικά ποσά εγχυτήρων χωρίς συνδετικούς εκδότες, για να παραγάγουν τις σύντομες μεταλλαγή-περιέχοντας ακολουθίες DNA από τις ενζυματικές διαδικασίες ενίσχυσης όπως οι αλυσιδωτές αντιδράσεις πολυμεράσεων (pcr). Μετά από αυτήν την ενιαία διαδικασία ενίσχυσης, τα εκδότης-περιέχοντας pcr υποπροϊόντα εξάγονται, πλένονται και διασπιούνται photolytically. Κοντά oligonucleotides παράγονται που διευκολύνουν τη μαζική spectrometric ανάλυση. Επιπλέον στη χρήση των συνδετικών εκδοτών, μερικοί τύποι εγχυτήρων μπορούν να περιέχουν blockers που σταματούν τη διαδικασία αντιγραφής πολυμεράσεων για να επιτυγχάνουν ακόμα κοντύτερα oligonucleotides για την ανάλυση.
