The invention is a solid state process for analyzing genomes by visualizing
sequence specific markers (e.g., proteins that bind a defined DNA sequence
elements) by scanning probe microscopy. The method includes linear display
of the nucleic acid on a solid surface, image acquisition by the scanning
probe microscope, and digital data analysis. The acts of the method result
in a bar code type display of each fragment of the DNA sample. These bar
codes are then used to place the fragments in the order they appear on the
original DNA sample.
L'invention est un procédé à semi-conducteurs pour analyser des génomes en visualisant les marqueurs spécifiques d'ordre (par exemple, les protéines qui lient les éléments définis d'un ordre d'ADN) en balayant la microscopie de sonde. La méthode inclut l'affichage linéaire de l'acide nucléique sur une surface pleine, l'acquisition d'image au microscope de sonde de balayage, et l'analyse de données numérique. Les actes du résultat de méthode dans un type affichage de code à barres de chaque fragment de l'échantillon d'ADN. Ces codes à barres sont alors employés pour placer les fragments dans l'ordre qu'ils apparaissent sur l'échantillon original d'ADN.
