Disclosed is a method for the comprehensive analysis of nucleic acid samples and a detector composition for use in the method. The method, referred to as Fixed Address Analysis of Sequence Tags (FAAST), involves generation of a set of nucleic acid fragments having a variety of sticky end sequences; indexing of the fragments into sets based on the sequence of sticky ends; associating a detector sequence with the fragments; sequence-based capture of the indexed fragments on a detector array; and detection of the fragment labels. Generation of the multiple sticky end sequences is accomplished by incubating the nucleic acid sample with one or more nucleic acid cleaving reagents. The indexed fragments are captured by hybridization and coupling, preferably by ligation, to a probe. The method allows a complex sample of nucleic acid to be quickly and easily cataloged in a reproducible and sequence-specific manner. One form of the method allows determination of associations, in a nucleic acid molecule, of different combinations of known or potential sequences. Another form of the method assesses modification of sequences in nucleic acid molecules by basing cleavage of the molecules on the presence or absence of modification.

È rilevato un metodo per l'analisi completa dei campioni dell'acido nucleico e una composizione nel rivelatore per uso nel metodo. Il metodo, citato come analisi fissa di indirizzo delle modifiche di sequenza (FAAST), coinvolge la generazione di un insieme dei frammenti dell'acido nucleico che hanno una varietà di sequenze appiccicose di conclusione; indexing dei frammenti in serie basate sulla sequenza delle estremità appiccicose; associando una sequenza del rivelatore con i frammenti; bloccaggio sequenza-basato dei frammenti spostati ad incrementi su un allineamento del rivelatore; e rilevazione delle etichette del frammento. La generazione delle sequenze appiccicose multiple di conclusione è compiuta incubando il campione dell'acido nucleico con gli uno o più acido nucleico che fende i reagenti. I frammenti spostati ad incrementi sono bloccati dall'ibridazione e dall'accoppiamento, preferibilmente tramite il ligation, ad una sonda. Il metodo permette che un campione complesso di acido nucleico catalogare rapidamente e facilmente in un modo di sequence-specifico e riproducibile. Una forma del metodo permette la determinazione delle associazioni, in una molecola dell'acido nucleico, delle combinazioni differenti delle sequenze conosciute o potenziali. Un'altra forma del metodo valuta la modifica delle sequenze in molecole dell'acido nucleico basando la fenditura delle molecole sulla presenza o sull'assenza di modifica.