A method for using an organic compound to label polynucleotides is described. The method utilizes an organic compound including an oligonucleotide, and electrophilic active site, an active complex, and a phosphate binding site. The oligonucleotide has a sequence that is complimentary to a specific region of a polynucleotide. This facilitates labeling of DNA or RNA at a specific site in its sequence. The active site consists of a stable precursor, and only becomes reactive upon activation. Leaving and protecting functional groups may be attached to the active site in order to facilitate the formation of a stable precursor and subsequent activation. The active complex may be a drug, polypeptide or a reporter molecule such as an isotope or fluorescing compound. The phosphate binding sites may be any functional group capable of forming ionic bonds with phosphate oxygens. Nucleotide labeling using this compound does not interfere with a polynucleotide sequence. The described method for utilizing this compound may be performed in situ. Latent reactivity is utilized to make the reaction chemically specific, alkylating only phosphodiester groups on the polynucleotide. A lactonization reaction traps the trialkylphosphate in a stable form.

Описан метод для использования органической смеси обозначить polynucleotides. Метод использует органическую смесь включая олигонуклеотид, и электрофильное активно место, активно комплекс, и связующий сайт фосфата. Олигонуклеотид имеет последовательность комплиментарно к специфически зоне polynucleotide. Это облегчает обозначать ДНАА или RNA на специфически месте в своей последовательности. Активно место состоит стабилизированного прекурсора, и только будет реактивным на активации. Выходя и защищая функциональные группы могут быть прикреплены к активно месту для того чтобы облегчить образование стабилизированного прекурсора и затем активации. Активно комплексом может быть снадобьем, полипептидом или молекулой репортера such as изотоп или флуоресцируя смесь. Связующие сайты фосфата могут быть любой функциональной группой способной формировать ионные скрепления с oxygens фосфата. Нуклеотид обозначая использующ эту смесь не мешает с последовательностью polynucleotide. Описанный метод для использовать эту смесь может быть выполнен in situ. Скрытая реактивность использована для того чтобы сделать реакцию химически специфически, алкилирующ только группы phosphodiester на polynucleotide. Реакция lactonization поглощает trialkylphosphate в стабилизированной форме.