The invention relates two general methods for performing PCR amplification, combined with the detection and analysis of the PCR products on a microchip. In the first method, the amplification occurs both outside and within a plurality of gel pads on a microchip, with at least one oligonucleotide primer immobilized in a gel pad. In the second method, PCR amplification also takes place within gel pads on a microchip, but the pads are surrounded by a hydrophobic liquid such as that which separates the individual gel pads into environments which resemble micro-miniaturized test tubes.

De uitvinding brengt twee algemene methodes om PCR versterking met elkaar in verband uit te voeren, die met de opsporing en de analyse van de PCR producten op een microchip wordt gecombineerd. In de eerste methode, komt de versterking zowel buiten en binnen een meerderheid van gelstootkussens op een microchip voor, met minstens één oligonucleotide inleiding die in een gelstootkussen wordt geïmmobiliseerd. In de tweede methode, PCR vindt de versterking ook binnen gelstootkussens plaats op een microchip, maar de stootkussens worden omringd door een hydrophobic vloeistof zoals dat die de individuele gelstootkussens in milieu's scheidt die op micro-verkleinde reageerbuizen lijken.