Methods and compositions are provided for detecting nucleic acid sequences.
In particular, pairs of probes are employed, where the pair defines a
substantially contiguous sequence on a target nucleic acid. Each of the
pairs has a side chain which forms a stem of the two side chains which
non-covalently binds and is capable of forming a cross-link upon
activation, when the probes and sample nucleic acid are base paired.
Cross-linking of the stems when unbound to complementary DNA is inhibited.
Each of the nucleic acids is initially present as single stranded nucleic
acid to allow for base pairing, so that the probes bind to homologous
target nucleic acid. The assay mixture is activated to provide
cross-linking, the double stranded nucleic acid melted, and the process of
base pairing, activation and melting repeated, a sufficient number of
cycles, to provide a detectable amount of cross-linked probes. To inhibit
background cross-linking, the side chains may provide for duplex
formation, where a portion of the side chain binds to a different portion
of the side chain or the portion of the probe homologous to the target.
Also provided are kits comprising reagents, as well as automatic devices,
for carrying out the subject method.
Методы и составы обеспечены для обнаруживать последовательности нуклеиновой кислоты. В частности, пары зондов использованы, где пара определяет существенн сопредельную последовательность на кислоте цели нуклеиновой. Каждая из пар имеет бортовую цепь формирует стержень обеих цепей стороны non-covalently binds и способны формировать cross-link на активации, когда зондами и кислотой образца нуклеиновой будут спаренное основание. Cross-linking стержней когда unbound к комплементарному ДНАУ заблокирован. Каждая из нуклеиновых кислот присутствует первоначально как одиночная, котор сели на мель нуклеиновая кислота для того чтобы позволить для низкопробный спаривать, так, что зонды свяжут к кислоте гомологичной цели нуклеиновой. Смесь assay активирована для того чтобы обеспечить cross-linking, двойную, котор сели на мель нуклеиновую расплавленную кислоту, и процесс низкопробный спаривать, активацию и плавить повторенные, что, достаточно количество циклов, обеспечила обнаруженное количество cross-linked зондов. Для того чтобы заблокировать cross-linking предпосылки, бортовые цепи могут обеспечить для двухшпиндельного образования, где часть бортовой цепи связывает к по-разному части бортовой цепи или части зонда гомологичного к цели. Также обеспечены наборы состоя из реагентов, также,как автоматические приспособления, для носить из subject метода.
