This invention provides methods of monitoring the expression levels of a
multiplicity of genes. The methods involve hybridizing a nucleic acid
sample to a high density array of oligonucleotide probes where the high
density array contains oligonucleotide probes complementary to
subsequences of target nucleic acids in the nucleic acid sample. In one
embodiment, the method involves providing a pool of target nucleic acids
comprising RNA transcripts of one or more target genes, or nucleic acids
derived from the RNA transcripts, hybridizing said pool of nucleic acids
to an array of oligonucleotide probes immobilized on surface, where the
array comprising more than 100 different oligonucleotides and each
different oligonucleotide is localized in a predetermined region of the
surface, the density of the different oligonucleotides is greater than
about 60 different oligonucleotides per 1 cm.sup.2, and the olignucleotide
probes are complementary to the RNA transcripts or nucleic acids derived
from the RNA transcripts; and quantifying the hybridized nucleic acids in
the array.
Cette invention fournit des méthodes de surveiller les niveaux d'expression d'une multiplicité de gènes. Les méthodes impliquent d'hybrider un échantillon d'acide nucléique à un choix à haute densité de sondes d'oligonucléotide où la rangée à haute densité contient des sondes d'oligonucléotide complémentaires aux subsequences des acides nucléiques de cible dans l'échantillon d'acide nucléique. Dans une incorporation, la méthode implique de fournir une piscine des acides nucléiques de cible comportant des transcriptions d'ARN d'un ou plusieurs gènes de cible, ou les acides nucléiques dérivés des transcriptions d'ARN, hybridant ladite piscine des acides nucléiques à un choix de sondes d'oligonucléotide immobilisées sur la surface, où la rangée comportant plus de 100 oligonucléotides différents et chaque oligonucléotide différent est localisée dans une région prédéterminée de la surface, la densité des différents oligonucléotides est les environ 60 oligonucléotides différents plus grands que par 1 cm.sup.2, et les sondes d'olignucleotide sont complémentaires aux transcriptions d'ARN ou aux acides nucléiques dérivés des transcriptions d'ARN ; et mesurant les acides nucléiques hybridés dans la rangée.
