Methods and compositions are provided for analyzing differences in the RNA profiles between a plurality of different physiological samples. In the subject methods, a set of a representational number of distinct gene specific primers is used to generate labeled nucleic acids from each of the different physiological samples. The labeled nucleic acids are then compared to each other and differences in the RNA profiles are determined. The subject methods find use in methods of identifying differential gene expression.

Des méthodes et les compositions sont données pour analyser des différences dans les profils d'ARN entre une pluralité de différents échantillons physiologiques. Dans les méthodes soumises, un ensemble d'un nombre représentatif d'amorces spécifiques de gène distinct est employé pour produire des acides nucléiques marqués de chacun des différents échantillons physiologiques. Les acides nucléiques marqués sont alors comparés entre eux et des différences dans les profils d'ARN sont déterminées. Les méthodes soumises trouvent l'utilisation dans les méthodes d'identifier l'expression différentielle de gène.