A biocompatible flow cytometry system such that low levels of bacteria or other particles in a sample will not adsorb onto the system's surfaces. The biocompatible flow cytometry system comprises an upper chamber assembly. The upper chamber comprises a biocompatible input system, a means for retaining and adjusting the biocompatible system, a sheath fluid input port, and a means of interfacing with a glass tube. The interface between the biocompatible system and a glass tube allows for the low level contaminants to be irradiated with a laser source selected to interact with marked bacteria and cause them to fluoresce at a wavelength that can be detected.

Ένα βιοσυμβατό cytometry σύστημα ροής έτσι ώστε τα χαμηλά επίπεδα βακτηριδίων ή άλλων μορίων σε ένα δείγμα δεν θα προσροφήσουν επάνω στις επιφάνειες του συστήματος. Το βιοσυμβατό cytometry σύστημα ροής περιλαμβάνει μια ανώτερη συνέλευση αιθουσών. Η ανώτερη αίθουσα περιλαμβάνει ένα βιοσυμβατό σύστημα εισαγωγής, μέσα για και το βιοσυμβατό σύστημα, έναν ρευστό λιμένα εισαγωγής θηκών, και μέσα με έναν σωλήνα γυαλιού. Η διεπαφή μεταξύ του βιοσυμβατού συστήματος και ενός σωλήνα γυαλιού επιτρέπει τους χαμηλούς μολυσματικούς παράγοντες επιπέδων που ακτινοβολούνται με μια πηγή λέιζερ που επιλέγεται για να αλληλεπιδράσει με τα χαρακτηρισμένα βακτηρίδια και να τους αναγκάσει για να φθορίσει σε ένα μήκος κύματος που μπορεί να ανιχνευθεί.