Compostions, kits and methods are provided for generating highly diverse libraries of proteins such as antibodies via homologous recombination in vivo, and screening these libraries against protein, peptide and nucleic acid targets using a two-hybrid method in yeast. The method for screening a library of tester proteins against a target protein or peptide comprises: expressing a library of tester proteins in yeast cells, each tester protein being a fusion protein comprised of a first polypeptide subunit whose sequence varies within the library, a second polypeptide subunit whose sequence varies within the library independently of the first polypeptide, and a linker peptide which links the first and second polypeptide subunits; expressing one or more target fusion proteins in the yeast cells expressing the tester proteins, each of the target fusion proteins comprising a target peptide or protein; and selecting those yeast cells in which a reporter gene is expressed, the expression of the reporter gene being activated by binding of the tester fusion protein to the target fusion protein.

Compostions, os jogos e os métodos são fornecidos gerando bibliotecas altamente diversas das proteínas tais como antibodies através do recombination homologous em vivo, e selecionando estas bibliotecas de encontro aos alvos da proteína, do peptide e do ácido nucleic usando um método do dois-híbrido no fermento. O método para selecionar uma biblioteca de proteínas do verificador de encontro a uma proteína ou a um peptide do alvo compreende: expressando uma biblioteca de proteínas do verificador em pilhas do fermento, cada proteína do verificador que é uma proteína da fusão compreendida de um primeiro subunit do polypeptide cuja a seqüência varie dentro da biblioteca, de um segundo subunit do polypeptide cuja a seqüência varie dentro da biblioteca independentemente do primeiro polypeptide, e de um peptide do linker que ligue os primeiros e segundos subunits do polypeptide; expressando um ou mais proteína da fusão do alvo nas pilhas do fermento que expressam as proteínas do verificador, cada uma das proteínas da fusão do alvo que compreendem um peptide ou uma proteína do alvo; e selecionando aquelas pilhas do fermento em que um gene do repórter é expressado, a expressão do gene do repórter que está sendo ativado pelo emperramento da proteína da fusão do verificador à proteína da fusão do alvo.