The present invention relates to a method for the rapid and reliable detection of drug-induced mutations in the reverse transcriptase gene allowing the simultaneous characterization of a range of codons involved in drug resistance using specific sets of probes optimized to function together in a reverse-hybridization assay. More particularly, the present invention relates to a method for determining the susceptibility to antiviral drugs of HIV strains present in a biological sample, comprising: (i) if need be releasing, isolating or concentrating the polynucleic acids present in the sample; (ii) if need be amplifying the relevant part of the reverse transcriptase genes present in said sample with at least one suitable primer pair; (iii) hybridizing the polynucleic acids of step (i) or (ii) with at least two RT gene probes hybridizing specifically to one or more target sequences with said probes being applied to known locations on a solid support and with said probes being capable of simultaneously hybridizing to their respective target regions under appropriate hybridization and wash conditions allowing the detection of homologous targets, or said probes hybridizing specifically with a sequence complementary to any of said target sequences, or a sequence wherein T is replaced by U; (iv) detecting the hybrids formed in step (iii); (v) inferring the nucleotide sequence at the codons of interest and/or the amino acids of the codons of interest and/or antiviral drug resistance spectrum, and possibly the type of HIV isolates involved from the differential hybridization signal(s) obtained in step (iv).

A invenção atual relaciona-se a um método para a deteção rápida e de confiança de mutations droga-induzidos no gene reverso do transcriptase permitindo a caracterização simultânea de uma escala dos codons envolvidos na resistência da droga usando jogos específicos das pontas de prova optimized para funcionar junto em um assay do reverso-reverse-hybridization. Mais particularmente, a invenção atual relaciona-se a um método para determinar o susceptibility às drogas antiviral das tensões do HIV atuais em uma amostra biológica, compreendendo: (i) se a necessidade for se liberando, isolando ou concentrando os ácidos polynucleic atuais na amostra; (ii) se a necessidade estiver amplificando a parte relevante dos genes reversos do transcriptase atuais em amostra dita com ao menos um par apropriado do primer; (iii) hybridizing os ácidos polynucleic da etapa (i) ou (ii) com ao menos as duas pontas de prova do gene do RT que hybridizing especificamente a um ou mais seqüência do alvo com as pontas de prova ditas que estão sendo aplicadas às posições conhecidas em uma sustentação contínua e com as pontas de prova ditas que são capazes simultaneamente de hybridizing a suas regiões respectivas do alvo sob circunstâncias apropriadas do hybridization e da lavagem permitindo a deteção de alvos homologous, ou pontas de prova ditas que hybridizing especificamente com uma seqüência complementar a algumas de seqüências ditas do alvo, ou uma seqüência wherein T é substituído por U; (iv) detectando os híbrido deu forma na etapa (iii); (v) inferring a seqüência do nucleotide nos codons do interesse e/ou dos aminos-ácido dos codons do interesse e/ou no spectrum antiviral da resistência da droga, e possivelmente o tipo de isolates do HIV envolvidos do signal(s) diferencial do hybridization obtido na etapa (iv).

 
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