There is disclosed an improved high-throughput and quantitative process for
determining methylation patterns in genomic DNA samples based on
amplifying modified nucleic acid, and detecting methylated nucleic acid
based on amplification-dependent displacement of specifically annealed
hybridization probes. Specifically, the inventive process provides for
treating genomic DNA samples with sodium bisulfite to create
methylation-dependent sequence differences, followed by detection with
fluorescence-based quantitative PCR techniques. The process is
particularly well suited for the rapid analysis of a large number of
nucleic acid samples, such as those from collections of tumor tissues.
On révèle une haut-sortie améliorée et un procédé quantitatif pour déterminer des modèles de méthylation dans les échantillons genomic d'ADN basés sur amplifier l'acide nucléique modifié, et détecter l'acide nucléique méthylé basé sur le déplacement amplification-dépendant de l'hybridation spécifiquement recuite sonde. Spécifiquement, le processus inventif prévoit traiter les échantillons genomic d'ADN avec du bisulfite de sodium pour créer des différences méthylation-dépendantes d'ordre, suivi de détection avec des techniques quantitatives fluorescence-basées de PCR. Le processus est en particulier bon adapté à l'analyse rapide d'un grand nombre d'échantillons d'acide nucléique, de ce type des collections de tissus de tumeur.