Disclosed is a method for the comprehensive analysis of nucleic acid
samples and a detector composition for use in the method. The method,
referred to as Fixed Address Analysis of Sequence Tags (FAAST), involves
generation of a set of nucleic acid fragments having a variety of sticky
end sequences; indexing of the fragments into sets based on the sequence
of sticky ends; associating a detector sequence with the fragments;
sequence-based capture of the indexed fragments on a detector array; and
detection of the fragment labels. Generation of the multiple sticky end
sequences is accomplished by incubating the nucleic acid sample with one
or more nucleic acid cleaving reagents. The indexed fragments are captured
by hybridization and coupling, preferably by ligation, to a probe. The
method allows a complex sample of nucleic acid to be quickly and easily
cataloged in a reproducible and sequence-specific manner. One form of the
method allows determination of associations, in a nucleic acid molecule,
of different combinations of known or potential sequences. Another form of
the method assesses modification of sequences in nucleic acid molecules by
basing cleavage of the molecules on the presence or absence of
modification.
Показан метод для обстоятельнаяа справка образцов нуклеиновой кислоты и состава детектора для пользы в методе. Метод, названный фикчировано адресует анализ бирок последовательности (FAAST), включает поколение комплекта частей нуклеиновой кислоты имея разнообразие липких последовательностей конца; индицирование частей в комплекты основанные на последовательности липких концов; связывать последовательность детектора с частями; последовательност-osnovanny1 захват индексированных частей на блоке детектора; и обнаружение ярлыков части. Выполняют поколение множественных липких последовательностей конца путем инкубировать образец нуклеиновой кислоты с one or more нуклеиновая кислота коля реагенты. Индексированные части захващены гибридизацией и соединением, предпочтительн перешнуровкой, к зонду. Метод позволяет сложный образец нуклеиновой кислоты быстро и легко каталогизировать в возпроизводимом и последовательност-speqificeski образе. Одна форма метода позволяет определение ассоциаций, в молекуле нуклеиновой кислоты, по-разному комбинаций знанных или потенциальных последовательностей. Другая форма метода определяет изменение последовательностей в молекулах нуклеиновой кислоты путем основывать расщепление молекул на присутсвии или отсутствии изменения.
