A method and apparatus are disclosed for identifying protein-coding regions in a nucleic acid sequence. In order to predict the coding regions within a sequence, a single metric is used without reference or comparison to a predetermined noise level or signal-to-noise ratio. This single metric, periodicity at 1/3, is analyzed using a discrete cosine transformation (DiCTion) function. For each open reading frame or sequence region, a score is generated using the discrete cosine transformation function. Regions within a sequence that have a score above a predetermined threshold are identified as protein-coding regions. The aspects of the invention may also be applied to gather other information from sequences, such as the location of the borders of a putative coding region, within a genomic sequence.

Une méthode et un appareil sont révélés pour identifier des régions de protéine-codage dans un ordre d'acide nucléique. Afin de prévoir les régions de codage dans un ordre, un métrique simple est employé sans référence ou comparaison à un niveau de bruit prédéterminé ou à un rapport signal/bruit. Ce métrique simple, périodicité à 1/3, est analysé en utilisant une fonction discrète de la transformation de cosinus (DiCTion). Pour chacun l'armature de lecture ou la région ouverte d'ordre, des points est produite en utilisant la fonction discrète de transformation de cosinus. Des régions dans un ordre qui ont des points au-dessus d'un seuil prédéterminé sont identifiées comme régions de protéine-codage. Les aspects de l'invention peuvent également être appliqués pour recueillir l'autre information des ordres, tels que l'endroit des frontières d'une région putative de codage, dans un ordre genomic.

 
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